Die System-PKI besteht aus einer Wurzelzertifizierungsstelle (Bezeichnung CA-1-SYSTEMPKI-HESSEN-ROOT) und untergeordneten Zertifizierungsstellen, die von der Hessischen Zentrale für Datenverarbeitung (HZD) betrieben werden. An dieser Stelle werden ausschließlich die Teile der System-PKI dargestellt, die in der Kommunikation mit Personen außerhalb der Landesverwaltung genutzt werden.
Derzeit werden von der Wurzelzertifizierungsstelle der System-PKI folgende Instanzen betrieben, die über einen zweistelligen Zähler gekennzeichnet sind: